Proportionale Oligo Pool-Synthese-Oligo Synthese Steuerdegenerierte Zündkapseln DNA

Oligo Synthese degenerierte Zündkapsel-kundenspezifische degenerierte Oligo Pool-Synthese DNA

DNA-oligos werden chemisch mit vier deoxyribonucleotides A, T, C und G. synthetisiert. Diese Reihenfolgen sind auf verschiedene Arten auf dem Gebiet der Biologie weit verbreitet. ZELLFREI ist in unserer Fähigkeit, hochwertige Oligo Produkte DNA zu den wissenschaftlichen Forschern und zu den Industrieabnehmern auf der ganzen Welt zur Verfügung zu stellen überzeugt. Mit der Kombination unseres hochmodernen synthesizers, modernen Fertigungstechnik und professionellen technischen Support - Teams haben wir durchweg niedrige Veränderungsrate, kurze Abfertigungszeiten, hoher Kostenverlauf erzielt.

Genetische Codes haben die Tendenz zu degenerieren, die zu den Gebrauch der degenerierten Zündkapseln in PCR-Experimenten zu den Ausstellungsbesonderegenen führen. ZELLFREI stellt den Entwurf und Synthese dieser degenerierten Zündkapseln sowie kundenspezifische degenerierte Oligo Poolsynthese auf Anfrage zur Verfügung.

Einleitung

Eine degenerierte Zündkapsel wird wie definiert: „Eine Mischung von Oligonucleotidereihenfolgen, in denen einige Positionen einige mögliche Basis enthalten, eine Bevölkerung von Zündkapseln mit ähnlichen Reihenfolgen gebend, die alle möglichen Nukleotidkombinationen für eine gegebene Proteinsequenz“ umfassen (Iserte 2013). Zum Beispiel:

ATCGTT [GASCHROMATOGRAPHIE] AAGT [AGC] ATC

bezieht sich eine Reihe auf Zündkapseln, in denen das Siebtel und die zwölften Nukleotide degeneriert sind. Die Menge von Entartung wird durch die Anzahl von verschiedenen Zündkapselkombinationen in der Mischung definiert. Das oben genannte Beispiel hat einen Entartungswert von sechs.

Halten Sie Liste instand

• Standardservice: Keine Entwurfsgebühr, passend für mehr als 95% PCR-Projekte.
• Überlegener Service: Verwendet für bestimmte Projekte empfindlich für Codonneigung. ZELLFREI kann die Abweichung erheblich verringern, die in den Syntheseverfahren inhärent ist und die genaue proportionale Steuerung verwirklichen.

* nichtstandardisierter niedriger Anteil sollte offenbar erklärt werden zum Beispiel N (20%A: 30%C: 40%G: 10%T).

Entwerfen von degenerierten Zündkapseln

1) Richten Sie mehrfache Aminosäurereihenfolgen unter Verwendung der freien on-line-Software aus.
2) visieren einen Bereich ungefähr 200-500 niedrige Paare in der Länge für optimale PCR-Verstärkung an.
3) bringen die Vorwärts- und Rückzündkapseln in mehr konservierten Regionen in Position – je weniger degeneriert, desto weiter auseinander können diese sein.
4) schließen zwischen 6 und 7 Aminosäuren in den Zündkapseln ein und stimmen mit ~15-20 niedrigen Paaren überein.
5) versuchen, Aminosäuren Methionin und Tryptophan mit einzuschließen, die durch einen einzelnen Codon (Dreibuchstabenukleotidcode) kodiert werden, und Aminosäuren Leucin, Serin und Arginin zu vermeiden, die jedes durch sechs Codonkombinationen kodiert werden können.
6) für folgende Klonenverfahren und Zunahmezündkapsellänge (und deshalb Ausglühentemperatur) fügen Sie 5' das Endstück (6-9 niedrige Paare) einen Restriktionsenzymstandort enthalten hinzu.
7) wenn es komplette Entartung (kein Match unter irgendwelchen gegebenen Spezies) gibt, erwägen Sie, das niedrige Inosin zu verwenden (strukturell ähnlich Guanin) da es mit irgendwelchen der vier Basis zusammenpassen kann, obgleich es an Cytosin vorzugsweise bindet. Wechselweise Einsatz N, damit irgendeine Basis Equimolar- Konzentrationen jeder Basis in dieser Position in Ihrer Zündkapsel mischen sicherstellt.
8) vermeiden Entartung am 3' Endstation (dieses würde kein guter Ort sein, zum des Inosins einzufügen).